Die häufigste Operation am Geschlechtstrakt ist die Kastration. Dabei werden beim weiblichen Tier die Ovarien (Eierstöcke) und beim männlichen Tier die Hoden entfernt.

Die Kastration der Hündin ist routinemäßig minimalinvasiv (laparoskopisch) möglich. (siehe minimalinvasive Chirurgie)

Bei Entzündungen der Gebärmutterschleimhaut (Endometritis / Pyometra) oder Tumoren wird es nötig nicht nur die Eierstöcke, sondern auch die Gebärmutter zu entfernen.

Auch Vaginalvorfälle (Scheidenvorfall) und -tumore gehören genauso in diesen Bereich, wie Tumore der Gesäugeleiste.

Beim -meist unkastrierten- Rüden können Operationen und Probennahme bei Veränderungen der Prostata wie z.B. Prostatazysten oder- abszessen nötig werden.